De acuerdo con las creencias de los pueblos indígenas, la primera transformación se realizó con la llegada de los españoles y para ellos, AMLO trae una segunda transformación con la que mejorará la calidad de vida de los pueblos indígenas y del país.
Esta dependencia sustituirá a la actual Comisión Nacional para el Desarrollo de los Pueblos Indígenas y tendrá autonomía operativa, técnica, presupuestal y administrativa.